Az osztály előtörténete 1904. január 1-ig nyúlik vissza, amikor a Budai Irgalmasrendi Kórház Fül-gége és Torokbeteg Osztálya 12 ággyal megkezdte működését, dr. Váli Ernő egyetemi magántanár vezetése alatt, akinek egy szakkönyv is fűződik a nevéhez (A fülgyógyászat tankönyve, 1921). Az első magyarországi osztály volt, ahol nem különült el a fül- és a gégebetegségek gyógykezelése.
Az osztályvezető főorvosok sorából kiemelkedett dr. Kratochwill Ede, aki az akkor létrehozott ORFI Fül-orr-gégészeti osztályát 1951-től 25 éven át vezette. Munkatársaival – köztük az osztályon ma is tevékenykedő dr. Gyeney László volt osztályvezető főorvossal – együtt európai színvonalú fül-orr-gégészetet hozott létre. Munkásságát Magyarországon otosclerosisban elsőként végzett stapedectomia is fémjelezte, amelyet még 400 otosclerosisban végzett műtét követett.
A következő osztályvezető, dr. Gerencsér Ferenc főorvos tudományos tevékenysége főként az egyensúlyzavarok diagnosztikájához kötődött. Orvostörténeti kutatásai számos új adatot, összefüggést tártak fel.
2000-ben – az 1995-től már dr. Gyeney László vezetése alatt működő fül-orr-gégészeti osztállyal együtt - az újjáalakult Betegápoló Irgalmasrend kapta vissza a Kórház tulajdonjogát.
2014-től dr. Koppány Judit főorvos vezeti az osztályt.